(共52张PPT)
复习——DNA的粗提取与鉴定
如何分离DNA与蛋白质?
如何析出DNA?
体积分数为95%的酒精(预冷)
加入研磨液(SDS)研磨;加热
如何溶解DNA?
2mol/L NaCl
如何鉴别DNA?
在一定温度下(沸水浴),DNA被二苯胺试剂(现配现用)染成_______
蓝色
复习——重组DNA技术的基本工具
限制酶
DNA连接酶
载体
①对受体细胞无害;
②有一个至多个限制酶切割位点;
③有特殊的标记基因;
④能自我复制或能整合到宿主DNA上。
质粒、噬菌体、动植物病毒
作为载体的条件
种类:
磷酸二酯键
来源:
主要来源于原核生物
特点:
作用部位:
具有专一性
结果:
形成黏性末端或平末端
连接部位:
种类:
作用:
磷酸二酯键
E.coliDNA连接酶、T4 DNA连接酶
把两条双链DNA片段拼接起来
第2节 基因工程的基本操作程序
讲课人:涂梦婷
第三章 基因工程
培育转基因抗虫棉的基本步骤
普通棉花
(无抗虫特征)
苏云金芽孢杆菌
(有抗虫特征)
提取
抗虫基因
棉花细胞
与载体DNA拼接,导入
(含抗虫基因)
植物组织培养技术
转基因抗虫棉
目的基因的筛选与获取
基因表达载体的构建
将目的基因导入受体细胞
目的基因的检测与鉴定
目的基因
定义
用于__________________或___________________等的基因。
改变受体细胞性状
获得预期表达产物
与生物抗逆性相关的基因
与生产药物相关的基因
与毒物降解相关的基因
与工业用酶相关的基因等
类型
主要指:编码蛋白质的基因
资料:苏云金杆菌通过产生苏云金杆菌伴胞晶体蛋白(Bt抗虫蛋白),破坏鳞翅目昆虫的消化系统来杀死棉铃虫。
当Bt抗虫蛋白被分解为多肽后,多肽与害虫肠上皮细胞的特异性受体结合,导致细胞膜穿孔,最后造成害虫死亡。
目的基因
定义
用于__________________或___________________等的基因。
改变受体细胞性状
获得预期表达产物
主要指:编码蛋白质的基因
目的基因的筛选
从相关的已知结构和功能清晰的基因中筛选。
DNA测序仪
序列数据库(如GenBank)
核苷酸序列比对
氨基酸序列比对
序列比对工具(如BLAST)
目的基因的筛选
目的基因的筛选
从相关的已知结构和功能清晰的基因中筛选。
目的基因的筛选
苏云金杆菌的杀虫作用于Bt基因有关
掌握了Bt基因的
序列信息
对Bt基因的表达产物-Bt抗虫蛋白有较为深入的了解
苏云金杆菌制剂可防治棉花虫害
Bt基因是培育转基因抗虫棉的目的基因
(1)人工合成
在我国首批具有较高抗虫活性的转基因抗虫棉的培育过程中,科学家采用的是人工合成的方法。
前提:
方法:
基因比较小、核苷酸序列已知
通过DNA合成仪用化学方法直接合成
DNA合成仪
转基因抗虫棉
目的基因的获取
若不明确基因碱基序列呢?
(1)人工合成
在我国首批具有较高抗虫活性的转基因抗虫棉的培育过程中,科学家采用的是人工合成的方法。
前提:
方法:
基因比较小、核苷酸序列已知
通过DNA合成仪用化学方法直接合成
DNA合成仪
转基因抗虫棉
目的基因的获取
蛋白质氨基酸序列
mRNA序列
基因序列
若核酸序列未知——反转录法
目的基因的获取
(2)从生物组织中直接获取
“鸟枪法”,又叫“散弹射击法”
①用限制酶将供体细胞中的DNA切成许多片段
②将这些片段分别连接到载体上,转入不同的受体细胞并使其表达
③若在某细胞中得到了目的产物,就说明该片段是所需的DNA片段
③一定的方法把带有目的基因的DNA片段分离出来
优点:
缺点:
操作简便,广泛使用;速度快,成本低
工作量大,盲目,分离出来的有时并非一个基因
目的基因的获取
(3)从基因文库中获取
将含有某种生物不同基因的许多DNA片段,导入到受体菌的群体中储存,各个受体菌分别含有这种生物的不同基因,称为基因文库。
基因组文库
部分基因文库
含有一种生物所有基因的文库
只含有一种生物部分基因的文库
(如:cDNA文库)
基因组文库
cDNA文库
补充——真核细胞的基因结构
编码区:
非编码区:
不编码蛋白质,含有能调控遗传信息表达的DNA序列
(如启动子、终止子)
能转录相应的信使RNA(mRNA),能编码蛋白质
RNA聚合酶识别并结合的部位,开始转录
补充——原核细胞的基因结构
非编码区
非编码区
启动子:RNA聚合酶的识别和结合位点 开始转录
编码区
原核生物基因
终止子:终止转录
编码区是连续的!
目的基因的获取
(4)利用PCR技术获取和扩增目的基因
PCR由穆里斯等人于1985年发明,为此,穆里斯于1993年获得诺贝尔化学奖。
目的基因的获取
(4)利用PCR技术获取和扩增目的基因
苏云金杆菌
Bt基因
快速获得大量Bt基因
提取
PCR技术
PCR技术
概念
PCR全称为___________________,是一项在生物________复制___________________的核酸合成技术
聚合酶链式反应
体外
特定DNA片段
①PCR的中文全称:
②操作环境:
③目的:
④原理:
⑤优点:
聚合酶链式反应
体外(PCR扩增仪/PCR仪)
对目的基因的核苷酸序列进行大量复制
DNA半保留复制
可以短时间内大量扩增目的基因
资料:PCR反应需要在一定的缓冲溶液中进行。真核生物和细菌的DNA聚合酶都需要Mg2+激活。因此,PCR反应缓冲溶液中一般要添加 。
Mg2+
1)解旋
在能量的驱动下,解旋酶将DNA双螺旋的两条链解开,氢键断裂。
解旋酶
ATP
2)合成引物(补充)
在引物酶的作用下,产生一小段RNA作为引物,后期引物会被切除
引物酶
引物
5’
3’
引物的作用简单理解就是引出DNA聚合酶,因为DNA聚合酶必须识别3’端才能结合上去。
引物是一小段能与DNA母链的一小段碱基序列互补配对的 。
短单链核酸
3)合成子链
DNA聚合酶等以解开的每一条母链为模板,以游离的4种脱氧核苷酸为原料,按照碱基互补配对原则,各自合成与母链互补的一条子链。
模板
模板
DNA聚合酶
5’
3’
子链延伸方向
子链延伸方向
两条子链延伸方向相反,但都是从5’→3’
随着模板链解旋过程的进行,新合成的子链也在不断延伸。
子链
母链
母链
5’
3’
5’
3’
3’
3’
5’
5’
子链
4)重新螺旋
每条新链与其对应的模板链盘绕成双螺旋结构。
体内DNA的半保留复制
参与的组分 在DNA复制中的作用
打开DNA双链的氢键
提供DNA复制的模板
合成DNA子链的原料
催化合成DNA子链
解旋酶
DNA两条母链
4种脱氧核苷酸
DNA聚合酶
引物
使DNA聚合酶能够从引物3′端连接脱氧核苷酸
DNA的合成方向总是从子链的5'端向3'端延伸。
解旋酶
5'端
3'端
5'端
3'端
由于DNA双链是反向平行的,所以需要 引物。
2种
体内DNA的半保留复制
PCR技术
耐高温的DNA聚合酶(Taq酶)
4种脱氧核苷酸
(dNTP-脱氧核苷三磷酸)
两种引物
待扩增的DNA片段(模板)
实际加入的是dATP dGTP dCTP dTTP
P
P
P
A
脱氧核糖
~
~
P
P
P
A
核糖
~
~
ATP
dATP
PCR技术
耐高温的DNA聚合酶(Taq酶)
4种脱氧核苷酸
(dNTP-脱氧核苷三磷酸)
两种引物
待扩增的DNA片段(模板)
实际加入的是dATP dGTP dCTP dTTP
P
P
P
碱基
脱氧核糖
~
~
(A、G、C、T)
作用:既可作为合成DNA子链的原料,
又可为DNA的合成提供能量
PCR技术
耐高温的DNA聚合酶(Taq酶)
4种脱氧核苷酸
(dNTP)
两种引物
待扩增的DNA片段(模板)
5’
5’
变性
复性
延伸
温度上升到90℃以上,双链DNA解聚为单链
当温度下降到50℃左右时,两种引物通过碱基互补配对与两条单链DNA结合。
温度上升到72℃左右时,溶液中的4种脱氧核苷酸在耐高温的DNA聚合酶的作用下合成新的DNA链。
PCR技术
变性
复性
延伸
温度:90℃以上
温度:50℃左右
过程:两种引物通过碱基互补配对与
两条单链DNA结合
温度:72℃左右
过程:4种脱氧核苷酸在耐高温DNA聚合酶的催化下,根据碱基互补配对原则,添加在引物的
_____端,合成新的DNA链。
(引物结合在模板链的______端)
反复循环
过程:目的基因DNA双链受热变性后解聚为单链
3’
上一轮的产物作为下一轮的模板
3’
引物的设计
设计引物的依据是:
目的基因两端的核苷酸序列
设计引物的要求
使用的一对引物的序列相同吗?
不相同,目的基因两端具有不同的核苷酸序列
①两种引物内部不能发生局部碱基互补配对
(防止引物自身折叠)
②两种引物之间不能在局部发生碱基互补配对
(防止引物之间配对,导致引物不能和模板链结合)
DNA聚合酶不能从头合成DNA,只能从引物的3′端开始延伸DNA链
需要引物的原因是:
项目 PCR技术 体内DNA复制
相同点 原理
原料
条件
不同点 场所
解旋方式
酶
引物
特点
是否需要ATP
温度条件
结果
碱基互补配对原则
四种脱氧核苷酸
均需要模板、引物、酶等
细胞外
(主要在PCR仪内)
(主要在细胞核内)
细胞内
DNA在高温下变性解旋
解旋酶催化
耐高温的DNA聚合酶(Taq酶)
解旋酶、普通的DNA聚合酶
一小段RNA或单链DNA分子片段
一小段RNA
体外迅速扩增
边解旋边复制
不需要(dNTP提供)
需要
需控制温度,在较高温度下进行
细胞内温和的条件
短时间内可形成大量的DNA片段
形成完整的DNA分子
PCR技术
PCR技术的数量关系
复制次数 1 2 3 n
DNA分子数
含引物的DNA分子数
含其中一种引物的DNA分子数
同时含两种引物的DNA分子数
共消耗引物数
共消耗引物对数
含等长的DNA分子数
PCR技术的数量关系
90
50
72
℃
变性
3`
5`
5`
3`
PCR技术的数量关系
90
50
72
℃
退火
PCR技术的数量关系
90
50
72
℃
延伸
PCR技术的数量关系
90
50
72
℃
变性
PCR技术的数量关系
90
50
72
℃
退火
PCR技术的数量关系
90
50
72
℃
延伸
PCR技术的数量关系
90
50
72
℃
变性
PCR技术的数量关系
90
50
72
℃
退火
PCR技术的数量关系
90
50
72
℃
延伸
PCR技术的数量关系
复制次数 1 2 3 n
DNA分子数
含引物的DNA分子数
含其中一种引物的DNA分子数
同时含两种引物的DNA分子数
共消耗引物数
共消耗引物对数
含等长的DNA分子数
2
2
3
2
2
4
4
8
8
1
1
0
0
0
3
7
2
6
14
7
6
2n
2n
2n-1
2n-2
2n-1
2n+1-2
2n-2n
思考: PCR技术获取目的基因时至少要经过几次循环才能从DNA分子中
分离出目的基因?
3次
PCR技术的数量关系
练习
1.DNA的复制需要引物,主要原因是( )
A.可加快DNA的复制速度
B.引物可与DNA母链通过碱基互补配对结合
C.引物的5′端有助于DNA聚合酶的延伸DNA链
D.DNA聚合酶只能从3′端延伸DNA链
D
练习
2.下列关于PCR技术的叙述,正确的是( )
A.该技术应用体内DNA半保留原理,也需要模板、原料、能量、酶等条件
B.PCR技术建立在对扩增的目的基因序列完全已知的基础上
C.该技术需要一对特异性的引物,要求一对引物的序列是互补的
D.该技术需要解旋酶和热稳定的DNA聚合酶
A
练习
3.目前广泛应用的新型冠状病毒检测方法是实时荧光RT-PCR技术。RT—PCR是将RNA逆转录(RT)和cDNA的聚合酶链式扩增反应相结合的技术,具体过程如图所示,下列说法不正确的是( )
A.引物A与引物B应该具有不同的碱基序列
B.过程Ⅱ通过控制温度的变化实现目标序列的循环扩增
C.该反应体系中应加入缓冲液、引物、四种核糖核苷酸、逆转录酶、Taq酶等物质
D.该检测方法的应用依赖于新型冠状病毒特异性序列的确定
C