(共32张PPT)
选择性必修3
第2节:基因工程的基本操作程序-4
探究实践 DNA片段的扩增及电泳鉴定
目的要求
1.了解PCR和电泳鉴定的基本原理
2.尝试进行PCR的基本操作并用电泳鉴定PCR的产物。
PCR仪器
电泳结果
PCR→PCR产物→电泳
实验
PCR仪
电泳装置
实验原理
1.DNA片段扩增原理
利用PCR在体外进行DNA片段扩增
①PCR利用了DNA热变性原理,通过调节温度来控制DNA双链的解聚与结合。
5’
3’
3’
5’
3’
5’
5’
3’
5’
3’
5’
5’
3’
5’
5’
3’
5’
5’
3’
5’
3’
3’
高温
变性
延伸
复性
低温
中温
1次循环
②PCR仪能够自动调控温度,一次PCR一般要经历30次循环。
2.电泳鉴定
①电泳
在电场作用下,带电分子会向着与它所带电荷相反的电极移动,这个过程称为电泳。
②琼脂糖凝胶电泳
PCR产物(DNA)一般通过琼脂糖凝胶电泳来鉴定。
电源
+
—
电泳槽
缓冲液
琼脂糖凝胶
加样孔
实验原理
2.电泳鉴定
③影响DNA迁移速率的因素
a.凝胶的浓度
b.DNA分子大小和构象
在碱性缓冲溶液中,DNA分子带负电,电泳时DNA从负极向正极迁移。
电源
+
电泳槽
琼脂糖凝胶
加样孔
缓冲液
—
2.电泳鉴定
④电泳结果的显示
凝胶中DNA分子通过染色,在波长为300nm的紫外灯下被检测出来。
较小的DNA片段在凝胶中的移动相对容易,较大的DNA片段移动难。
在同一浓度的凝胶中,较小的DNA片段迁移速度比大片段快。
大DNA片段
小DNA片段
Marker
bp:碱基对
常采用琼脂糖凝胶电泳技术来鉴定PCR扩增产物。
⑥PCR扩增产物的鉴定
较小的DNA片段在凝胶中的移动相对容易,较大的DNA片段移动难。
当电泳结束时,比较DNA样品所在的位置和一系列已知大小的DNA片段的位置(标准),这些已知大小的片段称为DNA分子量标准样。
材料用具
1.PCR过程使用的材料用具
扩增缓冲液(Mg2+)
4种脱氧核苷酸的等量混合液
2种引物
无菌水
TaqDNA聚合酶
模板DNA
离心机
PCR仪
微量离心管
微量移液器
一次性吸液枪头
用具
试剂
微量移液器
一次性吸液枪头
推动杆
调节旋钮
卸枪头按钮
体积刻度
吸液杆
枪头
(注意:吸取一种试剂更换一次枪头)
微量离心管
离心机
2.琼脂糖凝胶电泳过程使用的材料用具
琼脂糖
核酸染料
电泳缓冲液
凝胶载样缓冲液
电泳装置
(电泳仪、电泳槽等)
微量移液器
一次性吸液枪头
用具
试剂
电泳仪
电泳槽
制好的
琼脂糖凝胶
制胶模具
梳子
梳子
自主阅读书本P85,掌握探究实验的步骤。
1.DNA片段扩增的具体过程?
2.PCR扩增产物电泳鉴定的具体过程?
一.DNA片段扩增的具体过程
1.移液
用微量移液器按照PCR反应体系配方或PCR试剂盒的说明书,在微量离心管中依次加入各组分。
2.离心
待所有组分都加入后,盖严离心管的盖子,将微量离心管放入离心机里,离心约10s,使反应液集中在离心管的底部。
3.反应
参照下表的参数,设置好PCR仪的循环程序。将装有反应液的微量离心管放入PCR仪中进行反应。
循环程序 变性 复性 延伸
预变性 94℃,5min / /
30次 94℃,30s 55℃,30s 72℃,1min
最后一次 94℃,1min 55℃,30s 72℃,1min
预变性:使DNA充分变性,以利于引物更好地和模板结合。
延伸时间:可根据目的片段长度适当调整
方法步骤
4.配制琼脂糖溶液
琼脂糖
电泳缓冲液
加热至融化
稍冷却
根据待分离DNA片段的大小,确定琼脂糖溶液浓度的大小。
一般配制质量分数为0.8%~1.2%的琼脂糖溶液。
制成琼脂糖溶液
加入核酸染料
二.PCR扩增产物电泳鉴定的具体过程
5.制备琼脂糖凝胶
将温热的琼脂糖溶液迅速倒入模具,并插入合适大小的梳子,以形成加样孔。
梳子
6.将凝胶放入电泳槽内
待凝胶溶液完全凝固,小心拔出梳子,取出凝胶放入电泳槽内。
梳子
凝胶
电泳槽
凝胶
凝胶加样孔一极朝向电泳槽负极
7.加入电泳缓冲液
将电泳缓冲液加入电泳槽中,电泳缓冲液没过凝胶1mm为宜。
8.加样
扩增得到的PCR产物
凝胶载样缓冲液
混合液
注入凝胶加样孔
微量移液器
留一个加样孔加入指示分子大小的标准参照物
内含指示剂
显示电泳的过程
9.电泳
接通电源,根据电泳槽阳极至阴极之间的距离来设定电压,一般为1~5V/cm。
待指示剂前沿迁移接近凝胶边缘时,停止电泳。
10.电泳结果检测
取出凝胶置于紫外灯下观察和照相。
标准参照物
PCR扩增产物
注意事项
1.为避免外源DNA等因素的污染,PCR实验中使用的微量离心管、枪头和蒸馏水等在使用前必须进行高压灭菌处理。
2.该实验所需材料可以直接从公司购买,缓冲液和酶应分装成小份,并在-20℃储存。使用前,将所需试剂从冰箱拿出,放在冰块上缓慢融化。
3.在向微量离心管中添加反应组分时,每吸取一种试剂后,移液器上的枪头都必须更换。
4.在进行操作时,一定要戴好一次性手套。
DNA片段的扩增及电泳鉴定
结果分析
1.你是否成功扩增出DNA片段 判断的依据是什么
可以通过紫外灯下直接观察DNA条带的分布及粗细来评价扩增结果。
该片段大小约为750bp。
结果分析
2.你进行电泳鉴定的结果是几条条带 如果不止一条条带,请分析产生这个结果的可能原因。
未出现条带的可能的原因有:
①漏加了PCR的反应成分,
②各反应成分的用量不当,
③PCR程序设置不当
④Taq酶失活
⑤Mg+浓度过低
⑥引物出现质量问题
⑦变性时温度过低,变性时间短
如果扩增结果不止一条条带,可能的原因有:
①引物特异性不强,或形成引物二聚体
②复性温度过低
③模板DNA出现污染
总结
完成作业:
大本做到50页
一.概念检测
1.研究人员将一种海鱼的抗冻蛋白基因afp整合到土壤农杆菌的Ti质粒上,然后用它侵染番茄细胞,获得了抗冻的番茄品种。判断下列相关表述是否正确。
(1)afp基因是培育抗冻番茄用到的目的基因。 ( )
(2)构建含有afp基因的Ti质粒需要限制酶、DNA连接酶和核酸酶。( )
(3)只要检测出番茄细胞中含有afp基因,就代表抗冻番茄培育成功。( )
√
×
×
2.利用PCR既可以快速扩增特定基因,也可以检测基因的表达。下列有关PCR的叙述错误的是 ( )
A.PCR用的DNA聚合酶是一种耐高温酶
B.变性过程中双链DNA的解开不需要解旋酶
C.复性过程中引物与模板链的结合遵循碱基互补配对原则
D.延伸过程中需要DNA聚合酶、ATP和 4种核糖核苷酸
D
P83【练习与应用】二、拓展应用
2. 八氢番茄红素合酶(其基因用psy表示)和胡萝卜素脱饱和酶(其基因用crtl表示)参与β-胡萝卜素的合成。pmi为磷酸甘露醇异构酶基因,它编码的蛋白质可使细胞在特殊培养基上生长。科学家将psy和crtl基因转入水稻,使水稻胚乳中富含β-胡萝卜素,由此生产出的大米称为 “黄金大米”。请根据以上信息回答下列问题。
(1)科学家在培育“黄金大米”时,将ctrⅠ和psy基因导入含pmi基因的质粒中,构建了质粒pSYN12424。该项研究的目的基因是_____________________,标记基因是__________,质粒pSYN12424的作用是_______________________________。
(2)在构建质粒载体时,目的基因序列中能否含有用到的限制酶的识别序列?为什么?
ctrⅠ基因和psy基因
pmi基因
将目的基因送入水稻细胞
不能。
若目的基因序列中含有用到的限制酶的识别序列,则可能被切断。
二.PCR扩增产物电泳鉴定的具体过程
制备凝胶
4.融化
5.倒模
6.凝固
用电泳缓冲液配制琼脂糖溶液,一般配制质量体积比0.8%~1.2%的琼脂糖溶液。在沸水浴或微波炉内加热至琼脂糖熔化。稍冷却后,加入适量的核酸染料混匀。
将温热的琼脂糖溶液迅速倒入模具,并插入合适大小的梳子,以形成加样孔。
待凝胶溶液完全凝固,小心拔出梳子,取出凝胶放入电泳槽内。
进行电泳
7.加液
8.加样
9.电泳
将电泳缓冲液加入电泳槽中,电泳缓冲液没过凝胶1mm为宜。
将扩增得到的PCR产物与凝胶载样缓冲液(内含指示剂)混合,再用微量移液器将混合液缓慢注入凝胶的加样孔内。
留一个加样孔加入指示分子大小的标准参照物。
接通电源,根据电泳槽阳极至阴极之间的距离来设定电压,一般为1~5V/cm。待指示剂前沿迁移接近凝胶边缘时,停止电泳.
观察鉴定
10.取出凝胶置于紫外灯下观察和照相。