(共26张PPT)
转荧光基因大肠杆菌“画”的画
“荧光大肠杆菌”的诞生日记
GFP基因的获取、扩增与鉴定
生物 高三年级上学期
单元主题:基因工程
研究课题:荧光大肠杆菌的诞生日记
绿色荧光蛋白基因
( GFP基因)
“荧光大肠杆菌”
课题设计思路:
荧光水母
大肠杆菌
GFP基因表达
思考:水母是真核生物,而大肠杆菌是原核生物,来自水母的GFP基因可以在大肠杆菌杆菌中成功表达吗?
水母的基因结构
GFP 前体mRNA
转录
GFP成熟mRNA
汉水丑生侯伟作品
剪切、拼接
外显子
内含子
启动子
终止子
编码区(基因)
非编码区
非编码区
大肠杆菌的基因结构
编码区(基因)
启动子
终止子
转录
成熟mRNA
水母总mRNA
逆转录酶
杂交双链
核酸酶H
单链DNA
GFP基因
水母总cDNA
DNA聚合酶
大肠杆菌
cDNA不含有非编码序列--即启动子、终止子和内含子
知识拓展 :基因的结构
①如何获得并扩增绿色荧光基因(GFP基因)?
②如何鉴定扩增后的GFP基因?
任务清单:
研究课题:荧光大肠杆菌的诞生日记
编码荧光蛋白的核苷酸序列
GFP的cDNA
获取、扩增
1
目的基因(荧光基因等):
在基因工程的设计和操作中,用于改变受体细胞性状或获得预期表达产物等的基因。
主要指的是编码蛋白质的基因。
与生物抗逆性、优良品质、生产药物、毒物降解和工业用酶等相关的
任务一:如何获得并扩增GFP基因
GFP基因的获取、扩增与鉴定
合作探究1:阅读教材P77-79,以小组为单位思考回答以下问题
1.常用扩增GFP基因的方法、原理、目的?
2.结合体内DNA复制过程,思考扩增GFP基因需要哪些组分参与?
3.如何利用该方法特异性的获取GFP基因并扩增?
4.利用给出的材料模拟并讲述该过程。
GFP基因的获取、扩增与鉴定
任务一:如何获得并扩增GFP基因
GFP基因
快速获得大量GFP基因
PCR(Polymerase Chain Reaction)
1.常用扩增GFP基因的方法、原理、目的?
PCR是聚合酶链式反应的缩写,是一项根据DNA半保留复制,在体外提供参与DNA复制的各种组分与反应条件,可在短时间内对目的基因的核苷酸序列进行大量复制的技术。
原 理
目 的
PCR扩增仪
GFP基因的获取、扩增与鉴定
任务一:如何获得并扩增GFP基因
2.结合体内DNA复制过程,思考扩增GFP基因需要哪些组分参与?
任务一:如何获得并扩增GFP基因-PCR
GFP基因的获取、扩增与鉴定
条 件
模板:
原料:
能量:
酶:
DNA的两条母链
4种游离的脱氧核苷酸
ATP
解旋酶、DNA聚合酶
引物为DNA聚合酶提供了游离的3 ′端,使DNA聚合酶从3 ′端延伸子链。(DNA聚合酶不具有从头合成子链的功能)
2.结合体内DNA复制过程,思考扩增GFP基因需要哪些组分参与?
DNA(含GFP基因)模板
引物
4种脱氧核苷三磷酸(dNTP)
缓冲液
热稳定DNA聚合酶(Taq酶)
Mg2+
作为DNA复制的模板
使DNA聚合酶能从引物3′端开始连接脱氧核苷酸
作为合成DNA子链的原料
提供相对稳定的pH环境
催化合成DNA子链
真核细胞和细菌的DNA聚合酶都需要Mg2+激活
GFP基因的获取、扩增与鉴定
任务一:如何获得并扩增GFP基因-PCR
根据查询的GFP基因序列,尝试设计引物
要求:从①-④中选择2个合适的位置设计引物,写出引物的部分序列,并注明方向。
5’-ATG …… ATC GAG ACC GGT …… TAA-3’
3’-TAC …… TAG CTC TGG CCA …… ATT-5’
①
②
③
④
3’…... ATT-5’
5’-ATG…... 3’
1、PCR扩增时至少需要____种引物,原因是__________________________________
2
DNA的两条链是反向平行的(序列不同)
GFP基因序列
G T C C G A
2、设计引物的要求:
①2种引物之间不能发生碱基互补配对,原因__________________________
②同种引物之间不能发生碱基互补配对,原因__________________________
导致引物不能与模板链结合
防止引物自身折叠
实验原理
PCR利用了DNA的热变性原理,通过调节温度来控制DNA双链的解聚与结合,一次PCR一般要经历30次循环
尝试进行PCR的基本操作,获取和扩增GFP基因
目的要求
材料用具
RCR过程
主线任务:GFP基因的获取、扩增与鉴定
3.如何利用PCR特异性的获取GFP基因并扩增
H2O
扩增缓冲液
模板DNA
dNTP
引物Ⅰ、Ⅱ
Taq酶
移液
离心
循环程序 变性 复性 延伸
预变性 94℃5min
30次 94℃30s 55℃30s 72℃1min
最后一次 94℃1min 55℃30s 72℃1min
使DNA充分变性,以利于引物更好地与模板结合
扩增
T A...T C... TAG CTC TGGCCA ...C C...T T
3`
5`
A T...A G... ATC GAG ACCGGT ...G G...A A
5`
3`
...C C...T T5`
5`A T...A G...
RCR过程
第一轮
循环
变性
复性
延伸
当温度超过90℃时,双链DNA解聚为单链。
当温度下降到50℃左右时,两种引物通过碱基互补配对与两条单链DNA结合。
当温度上升到72℃左右时,溶液中的4种脱氧核苷酸在耐高温的DNA聚合酶的作用下,根据碱基互补配对原则合成新的DNA链。
T A...T C... TAG CTC TGGCCA
ATC GAG ACCGGT ...G G...A A
3.如何利用PCR特异性的获取GFP基因并扩增
合作探究2: 利用第一轮产物作为模版,选择合适的引物,确认引物放置的位置和方向,继续模拟PCR第二轮、第三轮的过程,并展示扩增结果。分别观察通过第二、三轮扩增是否可以获得GFP基因?
3`
5`
5`
3`
5`
5`
引物1
引物2
Taq酶
4.利用给出的材料模拟并讲述该过程
RCR过程
第一轮
循环
第二轮
循环
GFP基因的获取、扩增与鉴定
任务一:如何获得并扩增GFP基因-PCR
RCR结果
电泳鉴定
常采用琼脂糖凝胶电泳来鉴定PCR的产物。
GFP基因的获取、扩增与鉴定
任务二:如何鉴定扩增后的GFP基因
成指数形式扩增(约为2n,其中n为扩增循环的次数),一般循环30次,理论上可以将GFP基因扩大数百万倍。
实验原理
正 极
负 极
电场力
合作探究3:阅读P84-85,以小组为单位思考回答电泳实验原理
GFP基因的获取、扩增与鉴定
任务二:如何鉴定扩增后的GFP基因-电泳
电泳:
在电场的作用下,DNA、RNA、蛋白质等这些带电分子会向着与它所带电荷相反的电极移动,这个过程就是电泳。
正极
负极
电场力
一般使用的电泳缓冲液的pH为8,DNA分子带负电,向正极泳动,这个过程就是电泳
电泳:
DNA分子具有可解离的基团,在一定的pH下,这些基团可以带上正电荷或负电荷。
正极
负极
电场力
电泳常用缓冲液pH8.0~8.3
DNA分子在此pH条件下带负电荷
若此时电场里没有任何障碍物,所有DNA片段会以同样的速度向正极移动,怎么让它们移动速度不相同呢?
琼脂糖凝胶
琼脂糖凝胶是以琼脂糖为支持介质制备的凝胶。
琼脂糖的熔点在62 65°C之间,融化后在37°C下可维持液态数小时,30°C时凝固成胶。
加样孔
电泳:
正极
负极
电场力
琼脂糖凝胶
琼脂糖凝胶是以琼脂糖为支持介质制备的凝胶。琼脂糖的熔点在62 65°C之间,融化后在37°C下可维持液态数小时,30°C时凝固成胶。
加样孔
(加入待测DNA样本)
电泳:
正极
负极
电场力
琼脂糖凝胶
琼脂糖凝胶是以琼脂糖为支持介质制备的凝胶。琼脂糖的熔点在62 65°C之间,融化后在37°C下可维持液态数小时,30°C时凝固成胶。
片段短,迁移速率快
片段长,迁移速率慢
DNA分子的迁移速率与__________________、______________和_____ 等
有关
DNA分子越大,迁移速率越慢(一般情况下,除DNA分子大小外,在一个电泳槽中,其他因素可以认为是等同的)
怎么知道这些DNA片段的具体大小呢(bp)?
DNA分子大小
凝胶的浓度
构象
实验原理
DNA Marker是 的片段,在实验时和样本DNA同时进行凝胶电泳,通过对比两者的位置,可以大致估计 。
已知的DNA分子大小
样本DNA的大小
核酸染色剂
溴化乙锭(EB)可以插入到DNA分子的碱基对之间,并在紫外线的照射下发出荧光,所以我们需要在琼脂糖融化,稍冷却后,加入适量的EB混匀
标准参照(Marker)
GFP基因的获取、扩增与鉴定
任务二:如何鉴定扩增后的GFP基因-电泳
实验原理
材料用具
琼脂糖凝胶电泳装置
GFP基因的获取、扩增与鉴定
任务二:如何鉴定扩增后的GFP基因-电泳
待指示剂前沿迁移接近凝胶边缘时,停止电泳,取出凝胶置于紫外灯下观察和照相。
实验原理
材料用具
实验步骤
观察鉴定
GFP基因的获取、扩增与鉴定
任务二:如何鉴定扩增后的GFP基因-电泳
实验原理
材料用具
实验步骤
观察鉴定
电泳图分析
GFP基因片段大小约为710bp。
GFP基因的获取、扩增与鉴定
任务二:如何鉴定扩增后的GFP基因-电泳
进行电泳鉴定的结果应该是一条条带,该片段大小约为710bp。
HAPPY ENDING!